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膠回收常見(jiàn)問(wèn)題及對(duì)策

[2014/12/31]

  1. 沒(méi)有回收到DNA片段

  如在洗脫后,發(fā)現(xiàn)洗脫液中沒(méi)有DNA 片段,請(qǐng)檢查是否按瓶身標(biāo)簽,在洗滌液中加入了無(wú)水乙醇。

  2. 提取率低

  1) 融膠液為酸性緩沖液,如融膠后,其pH 值升高將影響提取得率。請(qǐng)加入0.1 倍體積的3M 乙酸鉀(pH5.0)。

  2) 長(zhǎng)時(shí)間使用后沒(méi)有更換的電泳緩沖液,其pH 值較高,將影響DNA 的吸附。請(qǐng)更換新的電泳緩沖液后,再進(jìn)行電泳,然后切膠。

  3) 回收片斷大小影響回收效率(見(jiàn)下圖);

  4) 在洗脫前,將洗脫液于30~60℃溫浴,可提高提取效率適當(dāng)延長(zhǎng)洗脫時(shí)間可增加回收效率。

  5) 正確估計(jì)膠大小,確保加入足夠量的Binding Buffer;使膠完全融解;

  6) 提高Binding Buffer用量可提高小片斷DNA回收效率.對(duì)于<100bp的DNA片斷,可加入6倍體積的Binding Buffer;

  3. 吸光度測(cè)量結(jié)果問(wèn)題

  吸光度測(cè)量的是未知樣品與調(diào)零標(biāo)準(zhǔn)之間的相對(duì)吸光度,所以請(qǐng)用與洗脫液體相同的液體,對(duì)測(cè)量樣品進(jìn)行稀釋和調(diào)零。

  4.如何計(jì)算提取率

  1) 由于回收前樣品中,往往含有非目的DNA 片段、引物、dNTP 等,所以不能用測(cè)回收前后吸光度的的方法計(jì)算回收率。

  2) 可將回收前后DNA 片段一起電泳,使用凝膠成像系統(tǒng)拍照后,用配套的軟件進(jìn)行電泳條帶灰度對(duì)比。

  3) 注意,電泳條件及拍攝條件將對(duì)灰度對(duì)比結(jié)果造成很大影響,請(qǐng)仔細(xì)操作,以減小誤差。

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