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典型PCR操作程序與優(yōu)化方法

[2015/9/14]

一、試劑
1引物根據(jù)待擴(kuò)增DNA不同,引物亦不同。
2耐熱DNA聚合酶:此酶是從耐熱細(xì)菌中分離出來的,能耐受高溫93~100℃)。
310x PCR緩沖液:500mm01LKCl; 100mmolLTris-HClpH8.4,20c,150mmolLMgCl2,lmgm1明膠。
45mmo1LdNTP貯備液:將dATP,dCTP,dGTPTdTTP鈉鹽各100mg合并,加3m1滅菌去離子水溶解,用NaOH調(diào)pH至中性,分裝每份300v1-20℃保存,dNTP濃度最好用uv吸收法精確測定。
5標(biāo)本處理試劑:不同標(biāo)本所需試劑不同,根據(jù)具體情況而定。

二、操作程序
利用PCR擴(kuò)增的操作程序基本相同,只是根據(jù)引物與靶序列的不同,選擇不同的反應(yīng)體系與循環(huán)參數(shù),基本的操作是將PCR必需反應(yīng)成分加入一微量離心管中,然后置于一定的循環(huán)參數(shù)條件下進(jìn)行循環(huán)擴(kuò)增。每個(gè)實(shí)驗(yàn)室或每個(gè)人都有不同的操作習(xí)慣,但需遵守一定的操作規(guī)范。推薦下述操作程序,因這樣操作可最大程度地增加反應(yīng)的成功率。
1向一微量離心管中依次加入:
ddH2O補(bǔ)至終體積終體積50~100ul
10xPCR緩沖液110體積
dNTP200umolL
引物各1umolL
DNA模板
混勻后,離心15s使反應(yīng)成分集于管底。
2加石蠟油50~100ul于反應(yīng)液表面以防蒸發(fā)。置反應(yīng)管于97c變性7min染色體DNA5min質(zhì)粒DNA。
3冷至延伸溫度時(shí),加入1~5UTaqDNA聚合酶,在此溫度作用1min。
4于變性溫度下使模板DNA變性適當(dāng)時(shí)間。
5在復(fù)性溫度下使引物與模板雜交一定時(shí)間。
6在延伸溫度下使復(fù)性的引物延伸合適的時(shí)間。
7重復(fù)4~625~30次。每次即為一個(gè)PCR循環(huán)。
8微量瓊脂德凝膠電泳檢查擴(kuò)增產(chǎn)物。


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