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科學(xué)家從人體細(xì)菌基因組中發(fā)現(xiàn)兩種新型抗生素

[2016/11/23]

目前使用的大多數(shù)抗生素其實(shí)是細(xì)菌產(chǎn)生的天然分子。由于細(xì)菌耐藥性的不斷增強(qiáng),醫(yī)學(xué)方面迫切需要研發(fā)新的的抗生素。然而,誘導(dǎo)細(xì)菌產(chǎn)生新的抗生素是一件棘手的事。大多數(shù)細(xì)菌不會(huì)在實(shí)驗(yàn)室中生長,就算實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)出了這些細(xì)菌,大多數(shù)的產(chǎn)生抗生素的基因很少表達(dá)。近日,洛克菲勒大學(xué)(RockefellerUniversity)的研究人員找到了解決問題的新方法。

研究人員發(fā)現(xiàn)殺死抗藥性金黃色葡萄球菌的新抗生素HumimycinAHumimycinB

研究人員從公共基因數(shù)據(jù)庫中找到存在人體內(nèi)的細(xì)菌基因組,然后使用專門的計(jì)算機(jī)軟件掃描數(shù)百個(gè)特定編譯合成非核糖體肽分子的基因簇,這些非核糖體肽是形成許多抗生素的基礎(chǔ)。最后他們使用軟件來預(yù)測基因簇產(chǎn)生的分子化學(xué)結(jié)構(gòu)。通過使用計(jì)算方法來選出微生物基因組中產(chǎn)生抗生素化合物的基因,然后跳過細(xì)菌培養(yǎng)過程直接合成這些化合物本身,用此類方法,他們已經(jīng)成功找到兩種新型抗生素。

發(fā)掘huminmycin之旅

從軟件最初確定的57個(gè)潛在有用的基因簇中,研究人員進(jìn)一步篩選出了30個(gè)基因簇。布蘭迪和他的同事們?nèi)缓笫褂靡环N固相肽合成的方法制造出了25種不同的化合物。

通過測試這些化合物對(duì)人類病原體的反應(yīng),研究人員成功篩選出了兩種抗生素,他們將其命名為HumimycinAHumimycinB。兩者都發(fā)現(xiàn)于一種稱為紅球菌屬細(xì)菌中,這是傳統(tǒng)細(xì)菌培養(yǎng)中從未發(fā)現(xiàn)的新抗生素。

葡萄球菌和鏈球菌是兩大危害人體的細(xì)菌,近年來它們對(duì)各種抗生素逐漸表現(xiàn)出抗性。實(shí)驗(yàn)表明,humimycins通過抑制細(xì)菌細(xì)胞壁合成酶來切斷細(xì)胞壁合成途徑,細(xì)菌當(dāng)即死亡。因而humimycins對(duì)這兩類細(xì)菌十分有效。

Humimycins的作用還不止如此。β-內(nèi)酰胺是一類廣泛應(yīng)用的處方抗生素,其效果常常隨著細(xì)菌出現(xiàn)抗藥性而消失。然而科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),其中一種humimycins可以用來重新敏化細(xì)菌,消除細(xì)菌對(duì)β-內(nèi)酰胺的抗藥性。

神奇的協(xié)同作用

在實(shí)驗(yàn)中,他們將具有β-內(nèi)酰胺抗性的葡萄球菌暴露于與β-內(nèi)酰胺抗生素和humimycinA的混合物中,發(fā)現(xiàn)細(xì)菌立刻死亡。即使HumimycinA含量很少時(shí),相同結(jié)果仍然出現(xiàn)。因此布蘭迪猜測兩種抗生素都對(duì)中斷細(xì)菌生命活動(dòng)起到了作用。

為了進(jìn)一步驗(yàn)證推論,布蘭迪和他的同事們用具有β-內(nèi)酰胺抗性的金黃色葡萄球菌感染小鼠。他們發(fā)現(xiàn)用含有humimycinA和β-內(nèi)酰胺抗生素的混合物處理的小鼠的效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于僅用任何其中一種藥物的小鼠。這給人們治療抗藥性金黃色葡萄球菌提供了一條新思路。

布蘭迪希望這一發(fā)現(xiàn)能夠激發(fā)更多科研團(tuán)隊(duì)挖掘細(xì)菌基因組,找到更多的新型抗生素。除此之外,布蘭迪建議大家的眼光可以不用局限在人體微生物的基因組,微生物的基因組是一片巨大的寶藏,等待著人類去開采。

(來源:深科技)

 


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